近日,由北京市疾控中心、中科院北京基因組研究所、清華、北大等單位聯(lián)合發(fā)表的一篇論文,揭示了對今年6月北京新發(fā)地疫情溯源的最新研究成果,結(jié)合流調(diào)與數(shù)據(jù)分析,新發(fā)地疫情可能源于受污染的進口食品經(jīng)冷鏈運輸帶來了從環(huán)境到人的傳播。
新發(fā)地疫情病毒毒株可能為境外輸入
6月11日,新發(fā)地疫情發(fā)生后,究竟起源于哪里一直沒有定論。近日,北京市疾病預(yù)防控制中心、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所、中國科學(xué)院北京基因組研究所、清華大學(xué)、北京大學(xué)的研究人員在《國家科學(xué)評論》(National Science Review)上發(fā)表題為“北京新冠肺炎疫情再現(xiàn)可能源于冷鏈食品污染”(Cold-chain food contamination as the possible origin of Covid-19 resurgencein Beijing)的研究論文。
該論文通過對今年6月北京疫情相關(guān)病例、環(huán)境與食品等樣品的核酸測序和病毒基因組序列分析,結(jié)合全面的流行病學(xué)調(diào)查和大數(shù)據(jù)分析,揭示了該疫情可能源于冷鏈食品污染,提出冷鏈運輸可能是新冠病毒傳播的新途徑。
自6月11日確診首例感染者后,北京對新發(fā)地市場538名員工擴大進行病毒核酸篩查,發(fā)現(xiàn)45人為陽性。6月15日,北京啟動了全市核酸篩查,通過對1000余萬人口和5342份環(huán)境樣本的檢測,共發(fā)現(xiàn)368人新冠病毒核酸陽性。這些感染者均與新發(fā)地市場有直接或者間接關(guān)聯(lián):其中169人是新發(fā)地市場的工作人員,103人于5月30日至6月12日期間去過新發(fā)地市場,其余96人均為上述人員的接觸者。未發(fā)現(xiàn)獨立于該市場的早期傳播鏈或獨立傳播鏈,提示新發(fā)地市場是此次疫情的單一暴發(fā)源。
研究團隊進一步利用自主開發(fā)的低病毒載量樣品處理方法,對110個病例和環(huán)境樣本進行了高通量核酸測序,共獲得了72條高質(zhì)量的新冠病毒基因組序列。分析發(fā)現(xiàn),這些序列均具有8個特征性突變位點,這些位點在我國此前的本土和輸入病例中從未發(fā)現(xiàn)過。與新冠病毒基因序列數(shù)據(jù)庫比對,發(fā)現(xiàn)除C6026T之外,具有其它7個突變位點的病毒主要存在于歐洲。這些結(jié)果進一步提示,新發(fā)地疫情病毒毒株可能為境外輸入。
論文推測,新發(fā)地疫情可能源于受污染的進口食品經(jīng)冷鏈運輸帶來了從環(huán)境到人的傳播。最近的一項研究發(fā)現(xiàn),在4℃和-20℃下放置21天后,新冠病毒在雞肉、三文魚和豬肉表面的傳染性沒有下降,表明冷鏈運輸污染食品可以延長病毒的存活期和傳播距離。
水產(chǎn)區(qū)S14號攤位可能是感染的源頭
論文中提到,結(jié)合新發(fā)地市場流行病學(xué)調(diào)查,研究人員初步確定綜合交易大廳地下一層(牛羊肉大廳)水產(chǎn)區(qū)S14號攤位可能是感染的源頭:S14號攤位的7位工作人員均為新冠確診病例,且癥狀出現(xiàn)時間相對較早,員工或其密切接觸者均未去過新冠肺炎病毒流行的中/高風(fēng)險地區(qū),或與這些地區(qū)的人員接觸。
根據(jù)流行病學(xué)模型推斷的疫情開始時間范圍內(nèi),共有5位顧客新冠抗體檢測陽性,且這5位顧客都到訪過S14號攤位。這5位顧客及其密切接觸者在過去14天內(nèi)都未到訪過中高風(fēng)險區(qū)域或接觸來自中高風(fēng)險區(qū)域的人員。
論文稱,進一步調(diào)查顯示,三文魚是S14號攤位售賣的唯一進口商品。
論文中提到,工作人員對位于新發(fā)地市場外的冷藏庫中所有原始密封包裝內(nèi)的三文魚進行了檢測,3582份樣品中,有6份檢測出了陽性,其中5份來自X公司,X公司5月30日曾為S14攤位供應(yīng)三文魚。通過測序,在X公司一份三文魚涂抹拭子中獲取到新冠病毒的16341個核苷酸,分析發(fā)現(xiàn)該毒株已測序列中,包括上述新發(fā)地疫情病毒毒株中8個突變中的3個。通過已發(fā)現(xiàn)的3個突變,推測X公司樣品毒株包含新發(fā)地疫情病毒毒株突變中7個及以上的概率為60%。
論文中提到,雖然尚不清楚三文魚身上的病毒載量是否足以造成感染,但食物和環(huán)境污染的風(fēng)險仍然存在。對于那些抑制了社區(qū)傳播的國家來說,這一發(fā)現(xiàn)十分重要,因為病毒可能通過冷鏈運輸?shù)谋晃廴疚镌俅蝹鞑?、甚至可能引發(fā)疫情。